心感军团和Clark总统的政府发现了埋藏在地球太阳系中的暗影飞船，他们开始利用这些飞船的先进技术。Clark政府继续变得越来越排外和极权主义，并以军事事件为借口宣布戒严。这引发了火星上的独立战争，火星长期以来一直与地球保持着紧张的政治关系。巴比伦 5 号也宣布从地球独立，以及其他几个外围地球联盟殖民地。作为回应，地球联盟试图用武力夺回巴比伦 5 号，但在与空间站结盟为对抗暗影威胁的 Minbari 的帮助下，地球联盟被击退。
　　Centauri大使隆多·莫拉里 （Londo Molari） 担心暗影在他的人民中日益增长的影响力，试图与他们断绝关系。暗影的人类代表Morden通过策划谋杀Londo的情妇来欺骗他恢复合作关系，并将责任归咎于Centauri的敌对家族。Shadows 与以 Babylon 5 和 Minbari 为首的联盟之间爆发了公开战争。人们了解到，Vorlons 操纵的基因是人类心灵感应的来源，随后发现暗影飞船容易受到心灵感应的攻击。Sheridan对 Vorlons 没有对 Shadows 采取直接行动感到不满，他威逼Vorlons大使科什-纳兰克（Kosh Naranek）对他们的共同敌人发动攻击。Kosh 的行为导致他随后被 Shadows 暗杀。
　　前空间站指挥官杰弗里·辛克莱 （Jeffrey Sinclair） 返回巴比伦 5 号，寻求Sheridan, Delenn, Ivanova, Marcus的帮助，夺取了巴比伦 4 号空间站，并将其送回 1,000 年，将其用作在之前的 Minbari-Shadow 战争中对抗暗影的作战基地。在第 1 季结束时，Sinclair 经历了与 Delenn 相同的转变，变成了 Minbari，随后被揭示为真正的 Minbari 传奇 Valen，而不是转世。Sheridan在他已故妻子（现在为 Shadows 工作）再次出现的刺激下，前往 Shadow 母星 Z'ha'dum，暗影试图招募他。然而，他却在自杀式核攻击中摧毁了他们的最大城市，并在爆炸中跳入数英里深坑中。在一场与暗影舰船的战斗中，Garibaldi失踪。©115FHD蓝光原盘电影分享站【www.115fhd.com】